BizteX Connect は kintone の API（エーピーアイ：システム同士がデータをやり取りするための仕組み）を通じてデータを取得します。

kintone API の仕様上、Connect 内部での処理順（API レスポンス順）が kintone の表示設定と必ずしも一致しないため、列の順番が kintone 画面と異なる場合があります。

対処方法

 「kintone レコードの一覧取得」アクションの基本設定「列の順序」にて、「取得するフィールドでの入力順」を指定し、「取得するフィールド」にて指定した順番通りの表データを取得することができます。

その後「表データをCSVファイルに出力」アクションにより、任意の順番でCSV出力が可能です。